Minggu, 24 Juni 2012

ANALISIS SEKUEN NUKLEOTIDA E/NS1 GENE JUNCTION VIRUS DENGUE SEROTIPE 2 ASAL DKI JAKARTA, INDONESIA

Nurhaida Widiani1, Tri Wibawa2, Nastiti Wijayanti3

ABSTRAK
Demam dengue atau demam berdarah dengue merupakan salah satu masalah kesehatan di daerah tropis dan subtropis.  Penyakit ini disebabkan oleh virus dengue (genus flavivirus, famili flaviviridae).  Vektor pembawa virus dengue adalah nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus.  Genom virus dengue tersusun atas tiga protein struktural (protein nukleokapsid, protein envelope, dan protein pre-membran) dan tujuh protein nonstruktural (NS1, NS2a, NS2b, NS3, NS4a, NS4b, dan NS5).  Usaha untuk mengontrol penyakit ini tergantung pada pemahaman patogenesis virus dengue.  Tetapi pengetahuan mengenai patogenesis virus dengue masih belum banyak diketahui karena belum adanya model yang cocok baik in vitro maupun in vivo. Sehingga dilakukan analisis sekuen nukleotida E/NS1 gene junction virus dengue tipe 2 asal DKI Jakarta, Indonesia untuk mengetahui hubungan filogeni virus dengue yang beredar saat ini.  Sekuen nukleotida (240 bp) dari E/NS1 gene junction merupakan segmen yang biasa digunakan untuk analisis perbandingan sekuen. Hasil analisis menunjukkan strain virus yang diteliti berkerabat dengan virus DEN-2 asal Asia yaitu Myanmar, Pakistan, Sri Lanka, Brunei, dan Malaysia.  Tetapi kelima virus ini berada dalam kelompok yang berbeda dengan virus asal Amerika latin (Brazil).  Virus Dengue dari Asia diduga lebih virulen dibandingkan virus dengue dari daerah lain. Sehingga kemungkinan terjadi peningkatan kasus DBD di Indonesia. 

Kata kunci: Virus Dengue, E/NS1 gene junction, serotype, filogeni, DEN-2   
1.    Jurusan Biologi, Fakultas Tarbiyah IAIN Raden Intan Lampung
2.    Departemen Mikrobiologi, Fakultas Kedokteran, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta
3.    Laboratorium Fisiologi Hewan, Fakultas Biologi, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta

Tidak ada komentar:

Posting Komentar